Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RpainQ9CWY9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RpainQ9CWY9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RpainQ9CWY9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms