Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BccipQ9CWI3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BccipQ9CWI3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BccipQ9CWI3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BccipQ9CWI3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms