Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Smc1aQ9CU62 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Smc1aQ9CU62 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Smc1aQ9CU62 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms