Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rprd1bQ9CSU0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rprd1bQ9CSU0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Rprd1bQ9CSU0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms