Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRZ8

Tspo2, Translocator protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspo2Q9CRZ8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tspo2Q9CRZ8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tspo2Q9CRZ8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspo2Q9CRZ8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tspo2Q9CRZ8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tspo2Q9CRZ8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspo2Q9CRZ8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspo2Q9CRZ8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspo2Q9CRZ8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tspo2Q9CRZ8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspo2Q9CRZ8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspo2Q9CRZ8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspo2Q9CRZ8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Tspo2Q9CRZ8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms