Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ska2Q9CR46 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ska2Q9CR46 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ska2Q9CR46 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms