Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR36

Gkn1, Gastrokine-1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkn1Q9CR36 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gkn1Q9CR36 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gkn1Q9CR36 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gkn1Q9CR36 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms