Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chchd5Q9CQP3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chchd5Q9CQP3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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