Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ndufb9Q9CQJ8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ndufb9Q9CQJ8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ndufb9Q9CQJ8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ndufb9Q9CQJ8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms