Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab27bQ99P58 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rab27bQ99P58 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rab27bQ99P58 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms