Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS4

Prss29, Serine protease 29, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss29Q99MS4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prss29Q99MS4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prss29Q99MS4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms