Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
KarsQ99MN1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KarsQ99MN1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KarsQ99MN1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KarsQ99MN1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms