Protein–RNA interactions for Protein: Q99LW6

Yaf2, YY1-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yaf2Q99LW6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Yaf2Q99LW6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Yaf2Q99LW6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Yaf2Q99LW6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Yaf2Q99LW6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yaf2Q99LW6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yaf2Q99LW6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yaf2Q99LW6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yaf2Q99LW6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yaf2Q99LW6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yaf2Q99LW6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Yaf2Q99LW6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms