Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sh3bp5lQ99LH9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp5lQ99LH9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5lQ99LH9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5lQ99LH9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5lQ99LH9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5lQ99LH9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5lQ99LH9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5lQ99LH9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5lQ99LH9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5lQ99LH9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5lQ99LH9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5lQ99LH9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5lQ99LH9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5lQ99LH9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp5lQ99LH9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh3bp5lQ99LH9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sh3bp5lQ99LH9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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