Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TrabdQ99JY4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TrabdQ99JY4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TrabdQ99JY4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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