Protein–RNA interactions for Protein: Q99J45

Nrbp1, Nuclear receptor-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrbp1Q99J45 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nrbp1Q99J45 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nrbp1Q99J45 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nrbp1Q99J45 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms