Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trps1Q925H1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trps1Q925H1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trps1Q925H1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms