Protein–RNA interactions for Protein: Q923U0

Tom1l1, TOM1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1l1Q923U0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tom1l1Q923U0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tom1l1Q923U0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tom1l1Q923U0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms