Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tmco4Q91WU4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tmco4Q91WU4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tmco4Q91WU4 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms