Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ccdc71Q8VEG0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc71Q8VEG0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc71Q8VEG0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 686.9 ms