Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BbxQ8VBW5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BbxQ8VBW5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BbxQ8VBW5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms