Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Vmn1r200Q8R281 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Vmn1r200Q8R281 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Vmn1r200Q8R281 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
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Vmn1r200Q8R281 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Vmn1r200Q8R281 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Vmn1r200Q8R281 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Vmn1r200Q8R281 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
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