Protein–RNA interactions for Protein: Q8R149

Bud13, BUD13 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud13Q8R149 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Bud13Q8R149 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bud13Q8R149 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms