Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxc12Q8K5B8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxc12Q8K5B8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxc12Q8K5B8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.9 ms