Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MyripQ8K3I4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MyripQ8K3I4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MyripQ8K3I4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms