Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A2

Trpt1, tRNA 2'-phosphotransferase 1, mousemouse

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpt1Q8K3A2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trpt1Q8K3A2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trpt1Q8K3A2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Trpt1Q8K3A2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Trpt1Q8K3A2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Trpt1Q8K3A2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trpt1Q8K3A2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trpt1Q8K3A2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trpt1Q8K3A2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Trpt1Q8K3A2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Trpt1Q8K3A2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Trpt1Q8K3A2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Trpt1Q8K3A2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Trpt1Q8K3A2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpt1Q8K3A2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpt1Q8K3A2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trpt1Q8K3A2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms