Protein–RNA interactions for Protein: Q8K349

Gimap6, GTPase IMAP family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimap6Q8K349 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gimap6Q8K349 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gimap6Q8K349 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Gimap6Q8K349 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Gimap6Q8K349 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Gimap6Q8K349 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gimap6Q8K349 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gimap6Q8K349 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gimap6Q8K349 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gimap6Q8K349 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gimap6Q8K349 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gimap6Q8K349 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gimap6Q8K349 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gimap6Q8K349 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gimap6Q8K349 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Gimap6Q8K349 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Gimap6Q8K349 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gimap6Q8K349 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gimap6Q8K349 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gimap6Q8K349 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gimap6Q8K349 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Gimap6Q8K349 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gimap6Q8K349 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gimap6Q8K349 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gimap6Q8K349 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Gimap6Q8K349 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms