Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nek9Q8K1R7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nek9Q8K1R7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nek9Q8K1R7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms