Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmem17Q8K0U3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem17Q8K0U3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms