Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E4

Eddm3b, Epididymal protein 3B, mousemouse

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Length 149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eddm3bQ8K0E4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eddm3bQ8K0E4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eddm3bQ8K0E4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eddm3bQ8K0E4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Eddm3bQ8K0E4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eddm3bQ8K0E4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Eddm3bQ8K0E4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms