Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cog3Q8CI04 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cog3Q8CI04 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog3Q8CI04 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog3Q8CI04 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog3Q8CI04 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog3Q8CI04 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog3Q8CI04 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog3Q8CI04 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog3Q8CI04 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog3Q8CI04 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog3Q8CI04 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog3Q8CI04 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog3Q8CI04 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cog3Q8CI04 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cog3Q8CI04 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cog3Q8CI04 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cog3Q8CI04 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cog3Q8CI04 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cog3Q8CI04 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cog3Q8CI04 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms