Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Rab11fip3Q8CHD8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rab11fip3Q8CHD8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
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