Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Upp2Q8CGR7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Upp2Q8CGR7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Upp2Q8CGR7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms