Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFZ4

Gpc3, Glypican-3, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc3Q8CFZ4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gpc3Q8CFZ4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gpc3Q8CFZ4 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gpc3Q8CFZ4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms