Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI7

Polr2b, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2bQ8CFI7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2bQ8CFI7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2bQ8CFI7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr2bQ8CFI7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2bQ8CFI7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2bQ8CFI7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2bQ8CFI7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2bQ8CFI7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2bQ8CFI7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr2bQ8CFI7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Polr2bQ8CFI7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Polr2bQ8CFI7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr2bQ8CFI7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms