Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDR2

Rsph6a, Radial spoke head protein 6 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph6aQ8CDR2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rsph6aQ8CDR2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rsph6aQ8CDR2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rsph6aQ8CDR2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms