Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcas3Q8CCN5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcas3Q8CCN5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcas3Q8CCN5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcas3Q8CCN5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Bcas3Q8CCN5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Bcas3Q8CCN5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bcas3Q8CCN5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bcas3Q8CCN5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms