Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1Y8

Ccz1, Vacuolar fusion protein CCZ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccz1Q8C1Y8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccz1Q8C1Y8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccz1Q8C1Y8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccz1Q8C1Y8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms