Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Strip1Q8C079 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Strip1Q8C079 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Strip1Q8C079 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms