Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Iffo1Q8BXL9 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Iffo1Q8BXL9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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