Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ5

Dclk3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk3Q8BWQ5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Dclk3Q8BWQ5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Dclk3Q8BWQ5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dclk3Q8BWQ5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Dclk3Q8BWQ5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms