Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVP1

Triml1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Triml1Q8BVP1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Triml1Q8BVP1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Triml1Q8BVP1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Triml1Q8BVP1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms