Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rd3Q8BRE0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rd3Q8BRE0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rd3Q8BRE0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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