Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Bicd1Q8BR07 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Bicd1Q8BR07 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Bicd1Q8BR07 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms