Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

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Length 924 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcaf1Q8BNE1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcaf1Q8BNE1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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Tcaf1Q8BNE1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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Tcaf1Q8BNE1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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Tcaf1Q8BNE1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcaf1Q8BNE1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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