Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AtripQ8BMG1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AtripQ8BMG1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtripQ8BMG1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms