Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL74

Gtf3c2, General transcription factor 3C polypeptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c2Q8BL74 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c2Q8BL74 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c2Q8BL74 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c2Q8BL74 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c2Q8BL74 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c2Q8BL74 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gtf3c2Q8BL74 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gtf3c2Q8BL74 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gtf3c2Q8BL74 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf3c2Q8BL74 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms