Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK84

Dupd1, Dual specificity phosphatase DUPD1, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dupd1Q8BK84 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Dupd1Q8BK84 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dupd1Q8BK84 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dupd1Q8BK84 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dupd1Q8BK84 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dupd1Q8BK84 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dupd1Q8BK84 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Dupd1Q8BK84 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dupd1Q8BK84 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dupd1Q8BK84 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dupd1Q8BK84 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dupd1Q8BK84 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dupd1Q8BK84 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dupd1Q8BK84 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms