Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIG4

Fbxo28, F-box only protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo28Q8BIG4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fbxo28Q8BIG4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fbxo28Q8BIG4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Fbxo28Q8BIG4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms