Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGH2

Samm50, Sorting and assembly machinery component 50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samm50Q8BGH2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Samm50Q8BGH2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Samm50Q8BGH2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Samm50Q8BGH2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samm50Q8BGH2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samm50Q8BGH2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samm50Q8BGH2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samm50Q8BGH2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Samm50Q8BGH2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms